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orf58 (mab_2101 homologue)基因對馬賽分枝桿菌菌落型態轉變的影響

為了解決dainese中文的問題，作者林品欣 這樣論述：

馬賽分枝桿菌(M. massiliense)屬於膿腫分枝桿菌複合物(M. abscessus complex)的一員，具有兩種菌落型態：平滑型及粗糙型，研究顯示菌落型態與致病力有相關性，然而，至今與菌落型態之轉換的機制尚未研究透徹。本實驗菌株是從同個病人體中被分離出來，具有高度同源性，依據菌落型態分別命名為R49R(粗糙型)及R49S(平滑型)，於全基因組定序結果發現，兩個菌株之基金組相比之下，R49R缺少長度約54-kb的序列，預測54-kb區域中含有58個開放式讀框(open reading frames, orf , orf1-58)，將orf58編碼出的胺基酸序列與資料庫比對後，發現

ORF58與Mab_2101有高度同源性。為了探討orf58是否與菌落型態的轉變有關，於R49S中大量表現orf58，結果菌落型態於平滑型態轉變成平坦粗糙型，且因此增加了細胞間聚集能力及降低滑行能力。ORF58被預測為Serine recombinase，其中含有三個主要的功能區，Resolvase、Recombinase和Zinc_ribbon。本研究證實只需要Resolvase及Zinc_ribbon即可改變菌落型態。雖然orf58會改變菌落型態，但是不會降低GPL的產量，此結果暗示orf58可能不會影響到GPL基因座。為了找尋受orf58調控的基因，將有或無大量表現orf58之R49S菌

株進行全轉錄體分析及qRT-PCR確認，結果發現有四個連續的基因，mycma_06840、mycma_06835、mycma_06830及mycma_06825。mycma_06840受orf58誘導產生。mycma_06840預測為一種一般型的壓力蛋白csbD，且orf58及mycma_06840之上游序列皆含有可能的σF and σB結合序列，因此，為了證實不同的環境壓力會誘導orf58、mycma_06840、sigB及sigF表現，本研究利用不同的壓力，測試上述四個基因表現量，證實冷休克、熱休克及缺氧壓力皆會誘導此四個基因表現量增加。然而，溶菌酶作用之下，只有sigB及mycma_06

840表現量增加，在此提出一個新的理論，σF 或 σB會誘導or58表現，OR58會調控mycma_06840-06825，導致R49S的菌落從平滑型轉變成粗糙型。