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國立臺灣海洋大學 水產養殖學系 劉秉忠、李國誥所指導 林佳勳的 文蛤養殖環境管理技術之探討 （2018），提出MSX125 GROM關鍵因素是什麼，來自於文蛤、大量死亡、弧菌、養殖管理。

而第二篇論文國立臺灣大學 生化科學研究所 邱繼輝所指導 黃興鴻的 全面性醣表位精準鑑定分析之質譜方法建立與應用 （2017），提出因為有 醣表位、醣質體、同分異構醣表位、數據獨立採集方法的重點而找出了 MSX125 GROM的解答。

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文蛤養殖環境管理技術之探討

為了解決MSX125 GROM的問題，作者林佳勳 這樣論述：

本論文旨在探討文蛤養殖技術並著重於整池後在養殖期間添加市售光合菌及益生菌以改善池底環境之效果及針對相關細菌做分離培養，以釐清養殖過程中所發生之緊迫因子，調查可能引發細菌性疾病原因，及可能對養殖造成之風險，以期提前採取疾病防治策略。本研究於現場訪查期間收集水質及底質之各項環境參數，並針對開始發生大量死亡之養殖池收集疑似感染之文蛤，進行細菌性病原分離，共取得41株疑似致病菌株，經由活菌注射初步攻擊試驗測試，篩選出15株具致病性之菌株，其中有3株能夠以優勢生長菌落再次被分離出來，再以菌株生化鑑定、16S rRNA等方法確認其皆為弧菌屬之弧菌，接著以正式攻擊試驗確認其為致病菌株。整池後添加光合菌及益

生菌，確實可以減少硫化物的累積及硫化氫的釋放，卻無法避免大量死亡，現場養殖過程中，溫度及鹽度兩項緊迫因子的劇烈變化，可能導致文蛤體質虛弱，且總生菌數及弧菌數在兩次採樣之間的數據最高可相差至1000倍，而使用1 ppm之二氧化氯消毒養殖池能夠控制疫情的擴散。依調查結果顯示，收成存活率在台南地區有較彰化地區高的趨勢，其原因可能是彰化地區底質老化及放養密度過高等。經由注射攻擊試驗結果只能判斷為多重細菌感染造成文蛤死亡，無法確認何者為其主要致病菌。根據研究結果，針對環境中潛在之Vibrio spp.擬定疾病防治策略，建議在季節轉換、梅雨季及夏季高水溫期應加強對池中弧菌數的監控，長年養殖下來，土地之底質

會逐漸老化，應增加翻動底質的頻率及曬池的時間，放養前務必實施整池工作，搭配使用光合菌及益生菌，恢復養殖池底的健康程度，並依建議改進日常養殖管理的模式，以降低文蛤可能受細菌特別是Vibrio spp.感染之風險。關鍵字：文蛤、大量死亡、弧菌、養殖管理

全面性醣表位精準鑑定分析之質譜方法建立與應用

為了解決MSX125 GROM的問題，作者黃興鴻 這樣論述：

醣質體於癌症與疾病中的研究目標包含希望能找到醣化作用在病理生理機制中的變化。特別是醣鏈上的醣表位分析，除了是重要的基本醣生物學研究目標，更可能是非常重要的疾病標記。而目前以質譜技術進行各種免疫細胞類型中特定醣鏈上硫酸化、唾液酸化醣表位分析以及全面性的針對生物樣本中醣表位具體量化分析，仍然是非常艱鉅的挑戰，並且很少被報導。本論文以實驗室既有的醣質體分析平台方法為基礎，進行兩種不同方向的分析方法開發。首先以多孔石墨碳(porous graphitized carbon)管柱分離技術為基礎，開發奈米流速多孔石墨碳層析質譜方法平台，針對表現於N型醣鏈上的硫酸化醣抗原之唾液酸鍵接位點進行結構確認及相對

比例定量。然而要精確定位醣鏈上硫酸化醣表位中硫酸根位置，則仍必須針對全甲基化醣鏈 (permethylated glycans) 進行二次與三次質譜實驗來確認。論文中結合不同分析方法的優點，能針對B-CLL患者收集的外周血單核細胞(PBMC) 上的抑制性B細胞受體 CD22上的特定硫酸化與唾液酸化醣鏈進行半定量監測。 而在另一方面，本論文的第二部分也是主要部分致力於探索不同的數據採集方法，來進行更全面醣質體研究的可行性。在此部分，本論文首次開發將數據獨立採集方法 (intelligent GlycOmics Data-independent-acquisition, iGODIA,

method) 應用於醣表位全面性與相對量化分析。並以BSM ( Bovine Maxillary Mucin)樣品中的全甲基化非硫酸化與硫酸化 O型醣鏈完整測試此方法應用於不同分析模式，包含正負電分析，二次與三次質譜分析 (MS2, MS3)，以及應用此方法進行醣質體定性定量實驗 (Quan/Qual experiments)，並建立最佳數據獨立採集方法和其儀器參數。更進一步結合產物離子資訊依賴三次質譜方法 (MS3) ，進行同分異構醣表位的相對含量定量分析，與當前的LC-MS2-pd-MS3數據依賴性採集模式相比，應用此數據獨立性採集模式方法 (iGODIA) 針對結腸癌三期患者組織樣品的

中的O型醣鏈上的特定醣表位進行定性定量分析，可證明此數據獨立性採集模式方法具備獨特分析優勢。

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