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探討草履蟲與綠藻共生之分子機制

為了解決Audi RS Q8的問題，作者鄭毓鋗 這樣論述：

內共生是在不同品系的真核生物演化過程中常見並且重要的推動力之一，然而，內共生在初始階段是如何形成以及宿主與共生個體如何形成穩定內共生關係的過程卻仍不是很清楚。因此，我們決定使用草履蟲以及綠藻作為研究物種來探討初始內共生關係的分子機制，Paramecium bursaria是在草履蟲屬中較早分化並且是在草履蟲屬中惟二可以和綠藻形成共生關係的物種，過去研究雖然有觀察到草履蟲與綠藻建立內共生關係時，綠藻在草履蟲胞內的分布變化以及諸如光線或是光合作用抑制劑等因素會影響內共生形成，但是對於有哪些基因參與調控這個現象卻仍不清楚。為了了解有哪些基因參與調控，我們首先定序組裝了高品質的基因體並且結合了不同族

群的基因體進行註解，我們發現基因體當中有一些蛋白質及基因家族的擴增可能和內共生現象有關，而藉由基因體分析我們也觀察到在該物種大核發育時的染色體重組現象有別於其他纖毛蟲，並且造成基因體中基因間的拷貝數差異極大，而細胞可能會藉由調控特定基因拷貝數以適應環境。接著，我們結合了基因體分析以及比較帶有共生綠藻及未帶有共生綠藻的宿主轉錄組分析篩選出可能和內共生調控相關的基因，並且進一步建立基因干擾技術以供未來驗證所需。另一方面，我們也發現不同品系的宿主能夠建立共生關係的綠藻物種及能力不同，我們也定序比較了不同宿主的基因體以尋找和共生現象相關的基因。最後，我們也發現共生關係能夠使得宿主對於致病菌有更高的抗性

。綜合以上，由我們的實驗結果發現在草履蟲基因體大規模的基因體拷貝數差異可能是一種幫助細胞適應環境的原始機制，而基因體的完善以及其後的轉錄體分析及實驗數據則為了內共生機制研究建立了基石。